| 基于國產申威眾核架構的二維材料分子動力學模擬算法優化 | |
| 所屬分類：技術論文 | |
| 上傳者：wwei | |
| 文檔大小：4572 K | |
| 標簽： 分子動力學模擬 高性能計算 LAMMPS | |
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| 文檔介紹：分子動力學（Molecular Dynamics，MD）模擬是探索微觀世界的重要工具，在多個領域中得到廣泛應用。二維材料是MD在材料科學領域的一個重要研究方向，其中層間作用力的計算是耗時最多的部分。高性能計算是能夠提升二維材料模擬效率的關鍵技術，利用新一代神威超級計算機的強大計算能力，來提高二維材料體系的MD模擬效率。針對層間力場的計算，采用消除冗余計算、多核心融合和設置緩沖區等多種算法優化策略；采用軟件Cache累加受力、從核通信累加能量和從核C++特性等技術實現線程級并行；采用軟硬件Cache協同策略提升訪存效率。實驗結果表明：優化后的整體性能提升155倍，模擬效率可達2 ns/day，弱擴展并行效率達到92.7%。 | |
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