2月29日，網傳一份來自百程旅行網的文件顯示，該公司決定關閉公司啟動清算準備。在這份名為《關于公司決定關閉公司啟動清算準備的通知》中，百程旅行網方面表示，受新冠疫情影響，百程資金不能維持公司繼續運轉。為此，公司將進行全面善后處理，請員工給予理解和支持，并提前做好自謀出路的準備。請所有員工在3月9日16：00點前完成公司財產歸還等事宜和手續。

　　在聯系百程旅行網管理層無果的情況下，2月29日下午，21世紀經濟報道通過百程旅行網的值班客服獲得證實，上述消息是真的，百程旅行網確實決定關閉公司業務，目前值班客服留守熱線和網上幫助乘客處理退款退訂事宜。

　　百程旅行網結業清算的消息引起旅游行業人士一片惋惜之聲。畢竟，作為新型出境旅行服務機構，百程旅行網曾在行業內獲獎無數，同時與70多家境外旅游局、全球50多家航空公司、30多萬家境外酒店、500多家境外合作商建立了良好的關系。

　　百程旅行網創始人、董事長兼CEO曾松曾創建中國出境游三大批發商之一的“華遠國旅”，2012年正式掌舵百程旅行網，并將公司帶上新三板。2016年4月23日，百程正式掛牌新三板，證券代碼836925。

　　當時百程提交的公開轉讓說明書顯示，阿里創投持有百程16.47%股份，為百程旅行的第二大股東，百程旅行創始人曾松及其妻子馬琳通過天津睿恒順和百程科技分別間接持有30.42%和3.08%的股權，合計持有33.80%的股權，為百程第一大股東。

　　百程旅行網的利潤狀況并沒有因為上市而好轉。其實在掛牌新三板之前，百程仍是虧損的。根據轉讓說明提供的數據，2013年、2014年、2015年1月-8月，百程的營收分別為1.8億元、1.8億元、1.9億元，同期凈利潤分別為-1760萬元、-3662萬元、-2479萬元。

　　隨后兩年雖然仍有虧損，但虧損額在減少。

　　2019年3月百程旅游網打算終止掛牌新三板。但是該議案被股東大會否決了，隨后恢復股票轉讓。